Muitos compostos são purificados por cristalização a partir de uma solução aquosa. O cristal exclui muitos contaminantes; no entanto, a água pode caber na estrutura cristalina sem ser quimicamente ligada ao cátion do composto. A aplicação de calor pode expulsar essa água, mas o processo normalmente danifica a estrutura cristalina. Isso é bom, se o objetivo é obter um composto puro. Pode ser indesejável ao cultivar cristais para cristalografia ou outros fins.
Às vezes, as duas formas são combinadas. Por exemplo, [Cu (H2O)4]ASSIM4· H2O pode ser usado para descrever a água de cristalização de sulfato de cobre (II).
A água é uma molécula polar pequena que é prontamente incorporada nas treliças de cristal, mas não é o único solvente encontrado nos cristais. De fato, a maioria dos solventes permanece, em maior ou menor grau, no cristal. Um exemplo comum é o benzeno. Para minimizar o efeito de um solvente, os químicos geralmente tentam remover o máximo possível usando a extração a vácuo e podem aquecer uma amostra para remover o solvente residual. A cristalografia de raios X pode frequentemente detectar solvente dentro de um cristal.