TBE e TAE são usados como tampões em biologia molecular, principalmente para eletroforese de ácidos nucleicos. Os tampões Tris são usados sob condições de pH ligeiramente básicas, como na eletroforese de DNA, porque isso mantém o DNA solúvel na solução e desprotonado para que seja atraído pelo eletrodo positivo e migre através de um gel. EDTA é um ingrediente na solução, porque este comum agente quelante protege os ácidos nucleicos da degradação por enzimas. O EDTA quela catiões divalentes que são cofatores de nucleases que podem contaminar a amostra. No entanto, uma vez que o cátion de magnésio é um cofator para a DNA polimerase e enzimas de restrição, a concentração de EDTA é mantida propositadamente baixa (concentração de cerca de 1 mM).
Você não precisa esterilizar a solução. Embora a precipitação possa ocorrer após um período de tempo, a solução-mãe ainda é utilizável. Você pode ajustar o pH usando um medidor de pH e adição gota a gota de concentrado ácido clorídrico (HCl). Não há problema em armazenar o tampão TBE à temperatura ambiente, embora você possa filtrar a solução padrão por um filtro de 0,22 mícron para remover partículas que promovam a precipitação.
O uso acidental de uma solução de estoque 5X ou 10X fornecerá resultados ruins, pois será gerado tanto calor. Além de fornecer uma resolução ruim, a amostra pode ser danificada.
Embora TBE e TAE sejam tampões comuns de eletroforese, existem outras opções para soluções condutoras de baixa molaridade, incluindo tampão de borato de lítio e tampão de borato de sódio. O problema com TBE e TAE é que os buffers baseados em Tris limitam o campo elétrico que pode ser usado em eletroforese, porque muita carga causa uma temperatura descontrolada.