Existem tantos fatos científicos que os cientistas e até o público em geral consideram certo em nossa sociedade moderna. No entanto, muitas dessas disciplinas que consideramos senso comum ainda não haviam sido discutidas no século XIX, quando Charles Darwin e Alfred Russel Wallace foram a primeira montagem da teoria da evolução através de seleção natural. Embora houvesse bastante evidência que Darwin sabia ao formular sua teoria, havia muitas coisas que sabemos agora que Darwin não sabia.
Genética, ou o estudo de como as características são passadas de pais para filhos, ainda não havia sido concretizado quando Darwin escreveu seu livro Na origem das espécies. Foi acordado pela maioria dos cientistas daquele período que a prole realmente tinha suas características físicas dos pais, mas como e em que proporções não era claro. Esse foi um dos principais argumentos que os oponentes de Darwin na época tinham contra sua teoria. Darwin não conseguiu explicar, para satisfação da multidão antirevolução, como essa herança aconteceu.
Não foi até o final do século XIX e início do século XX que Gregor mendel fez seu trabalho revolucionário com suas plantas de ervilha e ficou conhecido como o "Pai da Genética". Embora seu trabalho fosse muito sólido, ele apoio matemático e estava correto que levou algum tempo para alguém reconhecer o significado da descoberta de Mendel do campo de genética.
Como o campo da genética não existia até a década de 1900, os cientistas da época de Darwin não procuravam a molécula que transporta informações genéticas de geração em geração. Uma vez que a disciplina da genética se tornou mais difundida, muitas pessoas correram para descobrir exatamente qual molécula era essa que carregava essa informação. Finalmente, ficou provado que DNA, uma molécula relativamente simples, com apenas quatro blocos de construção diferentes, é de fato o portador de todas as informações genéticas de toda a vida na Terra.
Darwin não sabia que o DNA tornar-se uma parte importante de sua teoria da evolução. De fato, a subcategoria da evolução chamada microevolução baseia-se completamente no DNA e no mecanismo de como a informação genética é passada dos pais para os filhos. A descoberta do DNA, sua forma e seus componentes permitiram rastrear essas mudanças que se acumulam ao longo do tempo para impulsionar efetivamente a evolução.
Outra peça do quebra-cabeça que fornece evidências para o Síntese moderna da teoria evolucionária é o ramo da biologia do desenvolvimento chamado Evo-Devo. Darwin não tinha conhecimento das semelhanças entre grupos de diferentes organismos com o modo como se desenvolvem desde a fertilização até a idade adulta. Essa descoberta não foi aparente até muito tempo depois que muitos avanços tecnológicos estavam disponíveis, como microscópios de alta potência, e testes in vitro e procedimentos de laboratório foram aperfeiçoados.
Hoje, os cientistas podem examinar e analisar como um zigoto unicelular muda com base em dicas do DNA e do meio ambiente. Eles são capazes de rastrear semelhanças e diferenças de espécies diferentes e segui-las até o código genético em cada óvulos e esperma. Muitos marcos do desenvolvimento são os mesmos entre espécies muito diferentes e apontam para a idéia de que existe um ancestral comum para os seres vivos em algum lugar da árvore da vida.
Embora Charles Darwin tivesse acesso a um catálogo completo de fósseis que havia sido descoberto nos anos 1800, houve tantas descobertas fósseis adicionais desde sua morte que servem como evidência importante que apóia a Teoria da Evolução. Muitos desses fósseis "mais novos" são antepassados humanos que ajudam a apoiar a ideia de Darwin de "descida por modificação" de seres humanos. Embora a maior parte de sua evidência tenha sido circunstancial, ele levantou a hipótese de que os humanos eram primatas e estavam relacionados com macacos, muitos fósseis já foram encontrados para preencher os espaços em branco da evolução humana.
Embora a ideia de evolução humana ainda seja muito tópico controverso, mais e mais evidências continuam sendo descobertas, ajudando a fortalecer e revisar as idéias originais de Darwin. Essa parte da evolução provavelmente continuará controversa, no entanto, até que todos os intermediários fósseis da evolução humana foram encontrados ou a religião e as convicções religiosas das pessoas deixam de existir. Como é improvável que isso aconteça, continuará a haver incerteza em torno da evolução humana.
Outra evidência que temos agora para ajudar a apoiar a Teoria da Evolução é como as bactérias podem se adaptar rapidamente para se tornarem resistentes a antibióticos ou outras drogas. Embora médicos e médicos de muitas culturas usassem o mofo como inibidor de bactérias, a primeira descoberta e uso generalizados de antibióticos, como penicilina, não ocorreu até depois da morte de Darwin. De fato, a prescrição de antibióticos para infecções bacterianas não se tornou a norma até meados da década de 1950.
Não foi até anos depois que o uso generalizado de antibióticos se tornou comum que os cientistas entenderam que a exposição contínua aos antibióticos poderia conduzir o bactérias para evoluir e tornar-se resistente à inibição causada pelos antibióticos. Este é realmente um exemplo muito claro de seleção natural em ação. Os antibióticos matam qualquer bactéria não resistente a ela, mas as bactérias resistentes aos antibióticos sobrevivem e prosperam. Eventualmente, apenas as cepas bacterianas resistentes ao antibiótico funcionarão ou "sobrevivência do mais forte"bactérias ocorreram.
É verdade que Charles Darwin tinha uma quantidade limitada de evidências que poderiam se enquadrar na categoria filogenética, mas muita coisa mudou desde que ele propôs a Teoria da Evolução. Carolus Linnaeus possuía um sistema de nomeação e categorização quando Darwin estudou seus dados, o que o ajudou a formular suas idéias.
No entanto, desde suas descobertas, o sistema filogenético mudou drasticamente. Inicialmente, as espécies foram colocadas na árvore filogenética da vida com base em características físicas semelhantes. Muitas dessas classificações foram alteradas a partir da descoberta de testes bioquímicos e sequenciamento de DNA. O rearranjo de espécies impactou e fortaleceu a Teoria da Evolução ao identificar relações anteriormente perdidas entre as espécies e quando essas espécies se ramificaram antepassados.